8月28日《自然》杂志精选
时间:2017-12-07

  8月28日,“自然”杂志精选 - 新闻 - 科学网

  本文表明芳香族受体(AhR,已知识别环境毒素,自身分子和饮食成分)也是天然防御细菌的一部分,并作为肺病原体的显色毒力因子的直接传感器。细菌配体与AhR的结合通过负反馈回路促进其降解,同时促进细胞因子和趋化因子的产生。 AhR缺陷型小鼠对铜绿假单胞菌和结核分枝杆菌均​​高度敏感。

  线虫基因组转录因子图

  在本文中,modENCODE联盟已经调查了92个转录因子和调控蛋白在多个线虫发育阶段的结合位点的基因组分布。通过将这些数据与细胞分辨率表达数据整合,他们产生了后生动物转录因子结合位点的时空分布,用于研究发育调节回路的设计和性质。

  超新星2014J是一个经典的白矮星爆炸

  Ia型超新星是宇宙学的标准烛光,被认为源于白矮星的热爆炸,伴随着大量的放射性镍-56的释放,衰变成钴和铁。本文报道了首次检测到一种Ia型超新星SN 2014J的钴-56射线发射。观测到的光谱与经典模型大致相符,这个模型足够大,能够爆炸一颗不稳定的重力崩溃的白矮星,但不排除存在更复杂的合并情景。

  识别出作为运动检测器的神经元

  长久以来,果蝇视觉系统中的运动检测就被认为依赖于简单的Reichardt神经回路,它连接相邻的感觉神经元的时间略有延迟,但缺乏电生理证据。 Claudine Desplan及其同事在延髓进行活膜片钳记录,确定四个神经元:Mi1,Tm3,Tm1和Tm2,它们处理延迟和非延迟输入以检测光亮和黑暗运动的边缘。最近的神经解剖结果表明,哺乳动物视网膜运动检测机制的一些部分与果蝇Reichardt电路相似。

  miR-34a在骨髓中的作用

  破骨细胞参与骨吸收,因此在骨质疏松症和骨转移中起作用。 Yihong Wan及其同事发现了一种microRNA,miR-34a,其表达调控破骨细胞生成。 miR-34a的上调或转基因表达与较低程度的骨吸收有关,因此与骨量增加有关。 miR-34a参与这一过程的目标之一是Tgif2,它是一种促进破骨细胞生成的转录调节因子,其缺失可以独立于miR-34a来恢复骨量,这项研究表明miR-34a(癌症中的普遍缺失)对骨骼保护和改善癌性骨转移的策略的潜在治疗益处。

  在密切相关的物种之间的转录组差异

  在本文中,modENCODE联盟报告对人类,蠕虫和果蝇的转录组数据的比较分析,揭示了一些古老的,保守的特征,如在发育基因模块中丰富的共享共表达。表达模式被用来排列蠕虫和果蝇发育的不同阶段。所有三种生物的基因表达水平(包括编码和非编码基因)可以基于一组生物非依赖性参数使用一个模型从启动子上的染色质性状进行定量。

  果蝇转录组复杂性

  尽管动物中的所有细胞都具有相同的基因,但整个转录的基因(称为转录组)在细胞和组织中变化很大。来自modENCODE联盟的这篇论文检测了果蝇中一系列培养的细胞系和解剖器官系统中的这种差异,以确定转录组的多样性实际上有多大。例如,基本上神经元特异性基因的一小部分具有编码数千个信使RNA转录物的潜力,每个信使RNA通过广泛的选择性启动子使用和RNA剪接。此外,生殖腺表达数百个以前未知的编码RNA和长的非编码RNA(lncRNA),其中一些是与蛋白质编码基因反义的,并产生短的调控RNA。果蝇转录组显然比人们以前认识到的复杂。

  苍蝇和蠕虫被人类保留的基因

  这项研究描述了许多新的全基因组染色质数据集合生成的ENCODE联盟和modENCODE联盟从不同的细胞系和发展阶段的人类,果蝇和线虫。这些结果表明,三种生物的染色质中存在许多保守的特征,还有抑制性染色质的组成和位置的差异。

  (田学文/编译更多信息,请访问www.naturechina.com/st)

  中国科学通报(2014-09-09第二版国际)